酶標儀廣泛應用于低紫外區的DNA、RNA定量及純度分析（A260/A280）和蛋白定量（A280/BCA/Braflod/Lowery），酶活、酶動力學檢測，酶聯免疫測定（ELISAs），細胞增殖與毒性分析，細胞凋亡檢測（MTT），報告基因檢測及G蛋白偶聯受體分析（GPCR）等

    酶標儀（MicroplateReader）是對酶聯免疫檢測（EIA）實驗結果進行讀取和分析的專業儀器。酶聯免疫反應通過偶聯在抗原或抗體上的酶催化顯色底物進行的，反應結果以顏色顯示，通過顯色的深淺即吸光度值的大小就可以判斷標本中待測抗體或抗原的濃度。

    酶標儀廣泛地應用在臨床檢驗、生物學研究、農業科學、食品和環境科學中，特別在近幾年中，由于大量的酶聯免疫檢測試劑盒的應用，使得酶標儀在生殖保健領域中應用越來越廣泛，同時促進了生殖健康技術水平提高。

    目前國內許多計生站系統開展了酶免檢測項目，如：乙肝五項、艾滋病檢測、優生優育系列檢測、激素檢測等。過去多數采用目測方法，報出的結果缺乏科學的依據。例如：某弓形蟲檢測試劑盒中，臨界值規定為：陰性對照品的OD值×2.5，通過目測無法判斷標本孔的反應顏色是否超過臨界值。肉眼進行兩孔之間的顏色比較可能還行，但比較一孔的顏色是否超過另一孔顏色的2.5倍就不可能。

    國內多家權威機構，如衛生部臨床檢驗中心和計劃生育系統等多次強調酶標儀的重要性，并要求酶聯免疫檢測試劑應使用酶標儀判讀，酶免試劑的質控也應使用酶標儀，并提供酶標儀測定的原始數據，而各廠家的試劑盒說明書沒有是讓用目測的。同時酶免檢測的項目往往是一些實質性的感染和病變（如：肝炎、艾滋病、優生優育等），判讀更要求嚴謹，由誤診引起的糾紛很難處理。另外，住院手術病人術前的丙肝、愛滋等EIA試劑檢測是避免因輸血引起感染引發的醫療事故糾紛的必要手段，正逐漸被許多單位所采用。