實驗中波長的選擇主要依賴于你要測的樣品。樣品在不同的波長下，對光的吸收值也不同，但都有一個吸收峰，一般選擇吸收峰時的波長進行實驗。比如同樣是MTT法做細胞毒性實驗，就有使用490nm和570nm兩種波長選擇，如果使用了DMSO作為試劑，在溶解后呈紫（紅）色，在490nm有*大吸收值；而對于SDS和酸化異丙醇，則選用570nm（655nm作為參考波長）。

    酶標儀波長設定還要看你用的是什么酶標儀，如果是光柵式單色器（可以1nm步進調節），就可以直接設定吸收峰的波長；如果是濾光片式單色器，因為受濾光片波長限制，有時你就需要選接近使用波長的濾光片，比如655nm，你就可能選用650nm的濾光片。

    酶標儀和普通的光電比色計有以下幾點差異：

    （1）盛裝待測比色液的容器不再使用比色皿，而是使用塑料微孔板。微孔板常用透明的聚乙烯材料制成，對抗原抗體有較強的吸附作用，故用它作為固相載體。

    （2）由于盛樣本的塑料微孔板是多排多孔的，光線只能垂直穿過，因此酶標儀的光來都是垂直通過待測溶液和微孔板的，光束既可是從上到下，也可以是從下到上穿過比色液。

    （3）酶標儀通常不僅用A，有時也使用光密度OD來表示吸光度。

    酶標儀可分為單通道和多通道2種類型，單通道又有自動和手動2種之分。自動型的儀器有X，Y方向的機械驅動機構，可將微孔板L的小孔一個個依次送入光束下面測試，手動型則靠手工移動微孔板來進行測量。

    在單通道酶標儀的基礎上又發展了多通道酶標僅，此類酶標僅一般都是自動化型的。它設有多個光束和多個光電檢測器，如12個通道的儀器設有12條光束或12個光，12個檢測器和12個放大器，在X方向的機械驅動裝置的作用下，樣品12個為一排被檢測。多通道酶標儀的檢測速度快，但其結構較復雜價格也較高。